海陸巖石圈演化與礦產資源、區域環境與可持續發展。
自2006年中科院實施的知識創新工程試點三期以來,代表性創新成果有:1、持久性有機污染生物有效性研究;2、謝氏超晶石超高壓新礦物的發現和命名;3、構造成礦-控礦規律和深部找礦預測的研究;4、原油裂解成氣機理與評價研究;5、成礦預測和大型找礦靶區優選評價研究。2006-2008年,研究所2006年承擔的科研課題近300項,2007年和2008年均超過300項;2007和2008年每年到位科研經費超過8000余萬元。2006-2008年,作為第一主持單位獲準國家基金6481萬元,其中國家基金創新群體項目2項;國家杰出青年基金項目6項;國家基金重點項目5項;廣東省聯合基金3項。2008年主持973項目二級課題12項;國家攻關項目專題4項;863重大專項課題2項;專題課題7項。獲準地方科技經費824萬元。2006年以來獲得國家和省部級科研成果獎勵8項,其中國家自然科學二等獎1項,省部級一等獎5項。2006-2008年,全所共發表學術論文1467篇,其中SCI收錄的國際刊物論文439篇、SCI收錄的中國刊物論文120篇、中國核心刊物及統計源刊物論文908篇。
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