中國科學院成都生物研究所兩棲爬行動物、植物標本館
成都生物所兩棲爬行動物、植物標本館是在該所原植物標本館（建于1958年）和兩棲爬行動物標本館（建于1965年）的基礎上合并而成，是集科研、標本保藏、展覽、學術交流等功能為一體的具有國內先進水平的標本館，在兩棲爬行動物分類、系統演化方面的研究達到亞洲領先水平。
中國科學院武漢病毒研究所中國病毒標本館
中國科學院武漢病毒研究所創建了具有現代化展示手段的我國唯一的“中國病毒標本館”，集學科性、特色性和科普性于一體，是第一批“全國青少年走進科學世界科技活動示范基地”。
中國科學院華南植物園標本館
收集積累了維管束植物標本超過100萬號，其中有種子植物85萬號、苔蘚植物4萬號、蕨類植物4萬號、模式標本近7000號、復份標本8萬號，液浸標本6400號，使標本館得到長足發展，成為全國三大植物標本館之一。
中國科學院昆明植物研究所標本館
標本館現收藏植物標本110.0萬份，是國內收藏植物類群較全（涵蓋除藻類以外的所有植物門類）的標本館，收藏的植物標本來自全國，尤以西南及東喜馬拉雅地區的最為豐富。本館在中國乃至世界植物學研究、資源的開發利用及生物多樣性保護方面具有重要的地位，是中國植物學研究的重要基地。
中國科學院西雙版納熱帶植物園熱帶植物標本館
標本館是西雙版納熱帶植物園科研系統中技術支撐機構之一，對本園學科發展提供技術支撐服務，同時也為地方林業，環保，園林，海關，公安和科普等社會事業提供技術服務。
共存儲裝訂標本125013份。其中被子植物標本111137份，裸子植物標本700份，蕨類植物標本13158份，苔蘚植物標本18份，國內標本117606份，絕大部分為本館在滇南地區采集；國外標本有7407份，主要通過與泰國，越南，柬埔寨等東南亞國家的國際合作項目及標本交換獲得。
中國科學院西北高原生物研究所青藏高原生物標本館
標本館作為目前收藏、保存青藏高原這一特殊區域的生物標本數量最多、種類最全、館藏最豐富的標本館，其獨有的青藏高原特色，在全國乃至世界范圍內都是無可替代的。
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